Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc4Q6S5L9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms