Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx4Q6RUU0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms