Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc154Q6RUT8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc154Q6RUT8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms