Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc57Q6PHN1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms