Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms