Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms