Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY8

Trim45, Tripartite motif-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim45Q6PFY8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trim45Q6PFY8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms