Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rad54bQ6PFE3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms