Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms