Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dtx4Q6PDK8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms