Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd4aQ6PDC8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms