Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L6

Nsd3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsd3Q6P2L6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsd3Q6P2L6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nsd3Q6P2L6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms