Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms