Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HelbQ6NVF4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms