Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6DFW0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6DFW0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q6DFW0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Q6DFW0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q6DFW0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q6DFW0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q6DFW0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q6DFW0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q6DFW0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
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