Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms