Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmcc1Q69ZZ6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmcc1Q69ZZ6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmcc1Q69ZZ6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmcc1Q69ZZ6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmcc1Q69ZZ6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmcc1Q69ZZ6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms