Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Fgd6Q69ZL1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms