Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc2Q69ZB8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms