Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Spty2d1Q68FG3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms