Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Atg9aQ68FE2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Atg9aQ68FE2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Atg9aQ68FE2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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