Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms