Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Supt6hQ62383 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms