Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SypQ62277 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SypQ62277 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SypQ62277 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SypQ62277 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SypQ62277 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SypQ62277 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SypQ62277 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SypQ62277 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SypQ62277 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SypQ62277 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SypQ62277 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SypQ62277 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SypQ62277 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SypQ62277 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SypQ62277 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SypQ62277 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SypQ62277 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SypQ62277 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SypQ62277 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SypQ62277 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SypQ62277 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SypQ62277 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SypQ62277 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SypQ62277 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SypQ62277 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SypQ62277 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SypQ62277 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SypQ62277 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SypQ62277 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SypQ62277 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SypQ62277 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SypQ62277 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SypQ62277 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SypQ62277 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SypQ62277 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SypQ62277 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SypQ62277 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SypQ62277 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SypQ62277 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SypQ62277 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SypQ62277 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SypQ62277 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SypQ62277 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SypQ62277 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SypQ62277 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SypQ62277 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SypQ62277 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SypQ62277 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SypQ62277 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SypQ62277 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SypQ62277 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SypQ62277 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SypQ62277 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SypQ62277 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SypQ62277 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SypQ62277 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SypQ62277 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SypQ62277 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SypQ62277 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SypQ62277 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SypQ62277 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SypQ62277 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SypQ62277 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SypQ62277 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SypQ62277 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SypQ62277 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SypQ62277 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SypQ62277 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SypQ62277 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SypQ62277 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SypQ62277 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SypQ62277 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SypQ62277 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SypQ62277 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SypQ62277 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SypQ62277 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SypQ62277 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SypQ62277 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SypQ62277 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SypQ62277 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SypQ62277 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SypQ62277 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SypQ62277 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SypQ62277 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SypQ62277 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SypQ62277 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SypQ62277 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SypQ62277 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SypQ62277 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SypQ62277 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SypQ62277 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SypQ62277 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SypQ62277 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SypQ62277 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SypQ62277 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SypQ62277 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SypQ62277 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SypQ62277 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SypQ62277 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms