Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sall3Q62255 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sall3Q62255 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sall3Q62255 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sall3Q62255 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sall3Q62255 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sall3Q62255 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sall3Q62255 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sall3Q62255 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sall3Q62255 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sall3Q62255 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sall3Q62255 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sall3Q62255 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sall3Q62255 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sall3Q62255 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sall3Q62255 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sall3Q62255 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sall3Q62255 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sall3Q62255 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms