Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprrQ62132 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprrQ62132 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprrQ62132 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprrQ62132 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprrQ62132 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprrQ62132 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprrQ62132 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprrQ62132 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprrQ62132 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprrQ62132 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprrQ62132 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprrQ62132 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprrQ62132 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms