Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Odf1Q61999 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Odf1Q61999 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Odf1Q61999 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Odf1Q61999 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Odf1Q61999 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Odf1Q61999 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Odf1Q61999 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Odf1Q61999 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Odf1Q61999 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Odf1Q61999 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Odf1Q61999 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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