Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms