Protein–RNA interactions for Protein: Q61670

Hlx, H2.0-like homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HlxQ61670 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HlxQ61670 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HlxQ61670 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HlxQ61670 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HlxQ61670 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HlxQ61670 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HlxQ61670 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HlxQ61670 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms