Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms