Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gli3Q61602 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gli3Q61602 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms