Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msi1Q61474 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msi1Q61474 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msi1Q61474 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msi1Q61474 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msi1Q61474 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Msi1Q61474 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msi1Q61474 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msi1Q61474 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msi1Q61474 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msi1Q61474 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msi1Q61474 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msi1Q61474 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msi1Q61474 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msi1Q61474 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msi1Q61474 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msi1Q61474 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms