Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Irf9Q61179 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irf9Q61179 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms