Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxd3Q61060 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms