Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trpc1Q61056 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Trpc1Q61056 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc1Q61056 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Trpc1Q61056 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc1Q61056 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc1Q61056 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Trpc1Q61056 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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