Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JrkQ60976 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JrkQ60976 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
JrkQ60976 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JrkQ60976 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JrkQ60976 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JrkQ60976 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JrkQ60976 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
JrkQ60976 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms