Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Neurod1Q60867 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms