Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms