Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a1Q60737 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms