Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samhd1Q60710 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms