Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sik1Q60670 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms