Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf1Q5U4C3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms