Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms