Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms