Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
AbrQ5SSL4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AbrQ5SSL4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AbrQ5SSL4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AbrQ5SSL4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AbrQ5SSL4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AbrQ5SSL4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AbrQ5SSL4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AbrQ5SSL4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
AbrQ5SSL4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AbrQ5SSL4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AbrQ5SSL4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
AbrQ5SSL4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AbrQ5SSL4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AbrQ5SSL4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AbrQ5SSL4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AbrQ5SSL4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AbrQ5SSL4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AbrQ5SSL4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AbrQ5SSL4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AbrQ5SSL4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
AbrQ5SSL4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms