Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Utp18Q5SSI6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms