Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlha9Q5RJB0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlha9Q5RJB0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms