Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm12253Q5NC48 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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