Protein–RNA interactions for Protein: Q5M6W3

Clhc1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clhc1Q5M6W3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clhc1Q5M6W3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms