Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps41Q5KU39 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms